{"id":6322,"date":"2026-07-23T11:46:27","date_gmt":"2026-07-23T09:46:27","guid":{"rendered":"https:\/\/amsbiopharma.com\/?p=6322"},"modified":"2026-07-23T12:00:13","modified_gmt":"2026-07-23T10:00:13","slug":"descubrimiento-farmacos-hit-to-lead","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/amsbiopharma.com\/es\/descubrimiento-farmacos-hit-to-lead\/","title":{"rendered":"Fase de hit-to-lead en el descubrimiento de f\u00e1rmacos: estrategias anal\u00edticas para la validaci\u00f3n de impactos y la optimizaci\u00f3n de compuestos cabeza de serie"},"content":{"rendered":"<p><span style=\"font-weight: 400;\">Todo programa de mol\u00e9culas peque\u00f1as comienza con una pregunta aparentemente sencilla: \u00bfse une realmente este compuesto a la diana y puede convertirse en un f\u00e1rmaco? Transformar una se\u00f1al de cribado en una mol\u00e9cula que merezca la pena desarrollar constituye uno de los puntos de inflexi\u00f3n m\u00e1s decisivos en la fase de optimizaci\u00f3n de <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> a <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">leads<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> dentro del descubrimiento de f\u00e1rmacos. El cribado biof\u00edsico inicial es solo una parte del proceso; una vez confirmado el <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">, el an\u00e1lisis se centra en los <\/span><b>datos bioanal\u00edticos que determinan si la mol\u00e9cula es realmente viable para su desarrollo.<\/b><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>\u00bfQu\u00e9 son los <i>hits<\/i> en el descubrimiento de f\u00e1rmacos? Desde las bibliotecas de cribado hasta los candidatos confirmados<\/h2>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Un <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> (compuesto candidato inicial) es cualquier compuesto que muestre actividad reproducible frente a una diana terap\u00e9utica durante un proceso de cribado primario en el descubrimiento de f\u00e1rmacos; dicho proceso puede consistir en una campa\u00f1a de alto rendimiento que abarque m\u00e1s de un mill\u00f3n de compuestos, o bien provenir de una biblioteca codificada por ADN o de una colecci\u00f3n de fragmentos. Sin embargo, una se\u00f1al bruta de cribado no implica autom\u00e1ticamente una uni\u00f3n genuina. Los artefactos del ensayo, como la agregaci\u00f3n coloidal y la interferencia por fluorescencia, pueden generar falsos positivos indistinguibles de una interacci\u00f3n real bas\u00e1ndose \u00fanicamente en una lectura aislada.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Por este motivo, el proceso de identificaci\u00f3n de <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hits<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> en el descubrimiento de f\u00e1rmacos no concluye con el cribado primario. Los programas s\u00f3lidos aplican una estrategia de confirmaci\u00f3n de <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hits<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> que incorpora lecturas ortogonales antes de asignar recursos:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li aria-level=\"1\"><strong>Los m\u00e9todos estructurales<\/strong> <span style=\"font-weight: 400;\">(cristalograf\u00eda de rayos X, criomicroscop\u00eda electr\u00f3nica o cryo-EM) determinan la conformaci\u00f3n de uni\u00f3n, pero por s\u00ed solos no establecen la afinidad.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<ul>\n<li aria-level=\"1\"><strong>Los ensayos en fase de soluci\u00f3n<\/strong> <span style=\"font-weight: 400;\">(resonancia magn\u00e9tica nuclear [RMN], resonancia de plasm\u00f3n superficial [SPR] y calorimetr\u00eda de titulaci\u00f3n isot\u00e9rmica [ITC]) miden directamente la afinidad de uni\u00f3n; no obstante, no est\u00e1n exentos de artefactos propios, raz\u00f3n por la cual sigue siendo importante la validaci\u00f3n cruzada entre m\u00e9todos.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<ul>\n<li aria-level=\"1\"><strong>Los ensayos funcionales y celulares<\/strong> <span style=\"font-weight: 400;\">verifican que la actividad <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">in vitro<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> se traduzca en el efecto biol\u00f3gico esperado.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-6329 aligncenter\" src=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-1-300x200.webp\" alt=\"\u00bfQu\u00e9 son los hits en el descubrimiento de f\u00e1rmacos?\" width=\"877\" height=\"585\" srcset=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-1-300x200.webp 300w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-1-1024x683.webp 1024w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-1-768x512.webp 768w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-1-1536x1024.webp 1536w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-1-2048x1365.webp 2048w\" sizes=\"(max-width: 877px) 100vw, 877px\" \/><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Transici\u00f3n de<i> hit<\/i> a <i>lead<\/i>: criterios, puntos de decisi\u00f3n y la regla de 3<\/h2>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La diferencia entre un <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> y un compuesto l\u00edder (<\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">lead<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">) en el descubrimiento de f\u00e1rmacos radica tanto en los cambios en las propiedades moleculares como en la profundidad de la caracterizaci\u00f3n. Por lo general, un compuesto l\u00edder presenta una eficiencia de ligando mejorada y una relaci\u00f3n estructura-actividad definida, adem\u00e1s de indicios iniciales de selectividad frente a dianas no deseadas (<\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">off-targets<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">) relevantes; se trata de propiedades que un <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> confirmado a\u00fan no necesita demostrar. Alcanzar la etapa de transici\u00f3n de <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> a compuesto l\u00edder en el descubrimiento de f\u00e1rmacos constituye un punto de decisi\u00f3n que habitualmente requiere:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Ganancias de potencia que se correlacionan con la eficiencia del ligando<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\">, y no solo con el aumento del peso molecular: el compuesto se une con mayor eficiencia por \u00e1tomo, en lugar de simplemente unirse con m\u00e1s fuerza por haber ganado tama\u00f1o.<\/span><\/li>\n<li><strong>Un farmac\u00f3foro m\u00ednimo<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\">: el conjunto esencial de interacciones necesarias para la actividad, definido con suficiente claridad para orientar el dise\u00f1o de an\u00e1logos.<\/span><\/li>\n<li><strong>Propiedades fisicoqu\u00edmicas que tienden hacia el rango de biodisponibilidad oral<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\">, cuando la administraci\u00f3n por v\u00eda oral es la ruta objetivo del programa.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Los compuestos iniciales de tipo fragmento (<\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">fragment hits<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">) provienen de bibliotecas dise\u00f1adas seg\u00fan la regla de los tres, empleada habitualmente en programas de descubrimiento de f\u00e1rmacos, aunque se utiliza m\u00e1s como una directriz para la fase de cribado que como un criterio decisivo para la transici\u00f3n de <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> a <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">lead<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">. En la pr\u00e1ctica, solo dos de sus cuatro criterios originales han perdurado realmente: un peso molecular inferior a 300 Da y un logP calculado inferior a 3. Los propios autores de la regla han se\u00f1alado posteriormente que los otros dos criterios (un l\u00edmite de tres para los donantes y aceptores de enlaces de hidr\u00f3geno, respectivamente) nunca llegaron a consolidarse de la misma manera, en parte debido a la ausencia de un m\u00e9todo uniforme para contabilizarlos. Dado que los fragmentos se unen d\u00e9bilmente por dise\u00f1o, la optimizaci\u00f3n de <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hit<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> a <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">lead<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\"> para estos compuestos suele implicar la s\u00edntesis de entre 50 y 100 an\u00e1logos con el fin de desplazar la afinidad del rango milimolar al nanomolar, utilizando la eficiencia del ligando (y no la potencia bruta) como m\u00e9trica rectora durante todo el proceso.<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\" wp-image-6331 aligncenter\" src=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-2-300x172.webp\" alt=\"Transici\u00f3n de hit a lead\" width=\"829\" height=\"475\" srcset=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-2-300x172.webp 300w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-2-1024x585.webp 1024w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-2-768x439.webp 768w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/AM_2026_07_02_BLOG-2.webp 1247w\" sizes=\"(max-width: 829px) 100vw, 829px\" \/><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>M\u00e9todos anal\u00edticos para la caracterizaci\u00f3n de <i>hits<\/i> y la confirmaci\u00f3n estructural<\/h2>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La validaci\u00f3n de compuestos iniciales (<\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">hits<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">) en el descubrimiento de f\u00e1rmacos se basa en t\u00e9cnicas que van m\u00e1s all\u00e1 de una \u00fanica lectura. La resonancia magn\u00e9tica nuclear y los m\u00e9todos estructurales predominan en la selecci\u00f3n biof\u00edsica inicial, pero las <\/span><strong>aplicaciones de la espectrometr\u00eda de masas (EM) asumen gran parte de la carga anal\u00edtica<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\"> una vez que una serie entra en la fase de s\u00edntesis iterativa.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En el caso de los fragmentos covalentes, donde la interacci\u00f3n es irreversible, la EM de prote\u00ednas intactas detecta el aducto como un cambio claro en la masa, mientras que la EM en t\u00e1ndem permite identificar con exactitud qu\u00e9 residuo ha sido marcado. Igualmente importante es que la LC-MS confirma que cada an\u00e1logo reci\u00e9n sintetizado coincide con la estructura y pureza previstas antes de someterse a un ensayo de potencia. Este enfoque de m\u00faltiples niveles resulta especialmente crucial en el descubrimiento de f\u00e1rmacos basado en fragmentos, donde las afinidades iniciales d\u00e9biles hacen que las conclusiones derivadas de un \u00fanico m\u00e9todo carezcan de fiabilidad.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Una vez que una serie supera esta etapa, el enfoque anal\u00edtico cambia. Los datos sobre la relaci\u00f3n estructura-actividad obtenidos durante la confirmaci\u00f3n del compuesto inicial dan paso a una cuesti\u00f3n que requiere un an\u00e1lisis biol\u00f3gico m\u00e1s exhaustivo: \u00bfes esta mol\u00e9cula lo suficientemente estable, selectiva y absorbible como para resistir el contacto con un sistema vivo?<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Perfilado ADMET y optimizaci\u00f3n <i>leads<\/i>: equilibrio entre potencia y desarrollabilidad<\/h2>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La evaluaci\u00f3n del perfil ADME-T (absorci\u00f3n, distribuci\u00f3n, metabolismo, excreci\u00f3n y toxicidad) en el descubrimiento de f\u00e1rmacos analiza las propiedades farmacocin\u00e9ticas y de seguridad que determinan si un compuesto potente puede realmente sobrevivir al contacto con un sistema vivo, m\u00e1s all\u00e1 de simplemente unirse a su diana en un ensayo <\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">in vitro<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">. En otras palabras, es en esta etapa donde el proceso de optimizaci\u00f3n de compuestos cabeza de serie (<\/span><i><span style=\"font-weight: 400;\">lead optimization<\/span><\/i><span style=\"font-weight: 400;\">) cobra verdadero sentido.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Si estos aspectos cr\u00edticos no se abordan a tiempo, siguen siendo una de las principales causas de abandono de proyectos en la fase cl\u00ednica. Por ello, la optimizaci\u00f3n de compuestos cabeza de serie en qu\u00edmica m\u00e9dica desarrolla en paralelo l\u00edneas de trabajo centradas en la potencia y en la viabilidad de desarrollo, generando an\u00e1logos que requieren un soporte bioanal\u00edtico de alto rendimiento basado en UPLC-MS\/MS, tecnolog\u00eda que se ha convertido en la columna vertebral de los laboratorios de descubrimiento modernos:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><strong>Estabilidad metab\u00f3lica e inhibici\u00f3n de CYP (citocromo P450, las enzimas hep\u00e1ticas que metabolizan la mayor\u00eda de los f\u00e1rmacos):<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\"> dos de los par\u00e1metros ADME m\u00e1s consolidados, evaluados sistem\u00e1ticamente mediante t\u00e9cnicas de alto rendimiento (LC-MS\/MS) en los programas de descubrimiento.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><strong>Eficiencia lipof\u00edlica:<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\"> una m\u00e9trica que equilibra la potencia frente al aumento del peso molecular o del logP, identificando aquellas mejoras que conllevan un coste excesivo.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><strong>Filtrado multiparam\u00e9trico:<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\"> evaluaci\u00f3n de candidatos seg\u00fan propiedades similares a las de los f\u00e1rmacos y umbrales establecidos en el descubrimiento de medicamentos, antes de proceder a su s\u00edntesis.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Los grupos modernos de bioan\u00e1lisis para el descubrimiento de f\u00e1rmacos informan del desarrollo de cientos de m\u00e9todos de LC-MS\/MS y del procesamiento de miles de muestras semanales, con plazos de entrega de uno a dos d\u00edas laborables. Sin esa capacidad de procesamiento, incluso un ciclo qu\u00edmico bien dise\u00f1ado se paraliza a la espera de datos.<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>C\u00f3mo las CRO anal\u00edticas aceleran las campa\u00f1as de paso de <i>hit<\/i> a <i>lead<\/i><\/h2>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Pocos equipos pueden gestionar internamente toda la gama de m\u00e9todos bioanal\u00edticos de alto rendimiento que requieren los programas de descubrimiento de f\u00e1rmacos; esto es especialmente cierto en el caso de la capacidad de LC-MS\/MS necesaria para obtener datos sobre estabilidad metab\u00f3lica, permeabilidad y biomarcadores a la velocidad que exigen los ciclos de optimizaci\u00f3n de compuestos l\u00edderes. Aqu\u00ed es donde un socio CRO con experiencia anal\u00edtica aporta el verdadero valor mediante flujos de trabajo bioanal\u00edticos validados y de alto rendimiento que se adaptan a la escala del programa, evitando que el patrocinador desarrolle dicha infraestructura internamente.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En AMSbiopharma, apoyamos la optimizaci\u00f3n de compuestos l\u00edderes y la caracterizaci\u00f3n de candidatos mediante <\/span><strong>servicios bioanal\u00edticos de UPLC-MS\/MS<\/strong><span style=\"font-weight: 400;\">, abarcando estudios de DMPK,<\/span><span style=\"color: #0cd6b0;\"><a style=\"color: #0cd6b0;\" href=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/es\/metabolomica-lipidomica-desarrollo-farmacos\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> <span style=\"font-weight: 400;\">an\u00e1lisis de biomarcadores<\/span><\/a><\/span><span style=\"font-weight: 400;\"> y pruebas de control de calidad y de impurezas orientadas a estudios habilitantes para la solicitud de IND.<\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/es\/contactanos\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><span style=\"font-weight: 400;\"><span style=\"color: #0cd6b0;\">Contacta con nosotros<\/span><\/span><\/a><span style=\"font-weight: 400;\"> para analizar c\u00f3mo nuestras capacidades en bioan\u00e1lisis y biomarcadores pueden respaldar su programa de optimizaci\u00f3n de compuestos l\u00edderes.<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><b>Referencias<\/b><\/p>\n<p><i><span style=\"font-weight: 400;\">Grosjean H, Biggin PC. Developments and challenges in hit progression within fragment-based drug discovery. Nat Commun. 2026 Jan 31;17(1):2226. doi: <\/span><\/i><span style=\"color: #0cd6b0;\"><a style=\"color: #0cd6b0;\" href=\"https:\/\/doi.org\/10.1038\/s41467-026-68941-z\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><i><span style=\"font-weight: 400;\">10.1038\/s41467-026-68941-z<\/span><\/i><\/a><\/span><\/p>\n<p><i><span style=\"font-weight: 400;\">Jhoti H, Williams G, Rees DC, Murray CW. The &#8216;rule of three&#8217; for fragment-based drug discovery: where are we now? Nat Rev Drug Discov. Published online 12 July 2013. doi:<\/span><\/i><span style=\"color: #0cd6b0;\"><a style=\"color: #0cd6b0;\" href=\"https:\/\/doi.org\/10.1038\/nrd3926-c1\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> <i><span style=\"font-weight: 400;\">10.1038\/nrd3926-c1<\/span><\/i><\/a><\/span><\/p>\n<p><i><span style=\"font-weight: 400;\">Nippa DF, Atz K, Stenzhorn Y, M\u00fcller AT, Tosstorff A, Benz J, Binch H, B\u00fcrkler M, Haider A, Heer D, Hochstrasser R, Kramer C, Reutlinger M, Schneider P, Shema T, Topp A, Walter A, Wittwer MB, Wolfard J, Kuhn B, van der Stelt M, Martin RE, Grether U, Schneider G. Expediting hit-to-lead progression in drug discovery through reaction prediction and multi-dimensional optimization. Nat Commun. 2025 Nov 26;16(1):11646. doi: <\/span><\/i><span style=\"color: #0cd6b0;\"><a style=\"color: #0cd6b0;\" href=\"https:\/\/doi.org\/10.1038\/s41467-025-66324-4\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><i><span style=\"font-weight: 400;\">10.1038\/s41467-025-66324-4<\/span><\/i><\/a><\/span><\/p>\n<p><i><span style=\"font-weight: 400;\">Shou WZ. Current status and future directions of high-throughput ADME screening in drug discovery. J Pharm Anal. 2020;10(3):201-208. doi:<\/span><\/i><span style=\"color: #0cd6b0;\"><a style=\"color: #0cd6b0;\" href=\"https:\/\/doi.org\/10.1016\/j.jpha.2020.05.004\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> <i><span style=\"font-weight: 400;\">10.1016\/j.jpha.2020.05.004<\/span><\/i><\/a><\/span><\/p>\n<p><i><span style=\"font-weight: 400;\">Santiago BG, Eisennagel SH, Peckham GE, et al. Perspective on high-throughput bioanalysis to support in vitro assays in early drug discovery. Bioanalysis. 2023;15(3):177-191. doi:<\/span><\/i><span style=\"color: #0cd6b0;\"><a style=\"color: #0cd6b0;\" href=\"https:\/\/doi.org\/10.4155\/bio-2022-0207\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"> <i><span style=\"font-weight: 400;\">10.4155\/bio-2022-0207<\/span><\/i><\/a><\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><img decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-5779\" src=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/Logos-Galicia-Exporta-3-300x40.png\" alt=\"\" width=\"813\" height=\"108\" srcset=\"https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/Logos-Galicia-Exporta-3-300x40.png 300w, https:\/\/amsbiopharma.com\/wp-content\/uploads\/Logos-Galicia-Exporta-3.png 750w\" sizes=\"(max-width: 813px) 100vw, 813px\" \/><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<div class=\"entry-summary\">\nTodo programa de mol\u00e9culas peque\u00f1as comienza con una pregunta aparentemente sencilla: \u00bfse une realmente este compuesto a la diana y puede convertirse en un f\u00e1rmaco? 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